src/molecule.cc


1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144

#include "glob.hh"
#include "dimen.hh"
#include "string.hh"
#include "molecule.hh"
#include "symbol.hh"
#include "debug.hh"
#include "tex.hh"

void
Atom::print() const
{
    mtor << "texstring: " <<sym.tex<<"\n";    
}

Box
Atom::extent() const
{
    Box b( sym.dim);
    b.translate(off);
    return b;
}

Atom::Atom(Symbol s)
{
    sym=s;
}


String
Atom::TeXstring() const
{
    // whugh.. Hard coded...
    String s("\\placebox{%}{%}{%}");
    svec<String> a;
    a.add(print_dimen(off.y));
    a.add(print_dimen(off.x));
    a.add(sym.tex);
    return substitute_args(s, a);
}


String
Molecule::TeXstring() const
{
    String s;
    for(PCursor<Atom*> c(ats); c.ok(); c++)
	s+=c->TeXstring();
    return s;
}

Box
Molecule::extent() const
{
    Box b;
    for(PCursor<Atom*> c(ats); c.ok(); c++)
	b.unite(c->extent());
    return b;
}

void
Molecule::translate(Offset o)
{
    for (PCursor<Atom*> c(ats); c.ok(); c++)
	c->translate(o);
}

void
Molecule::add(const Molecule &m)
{
    for (PCursor<Atom*> c(m.ats); c.ok(); c++) {
	add(**c);
    }
}

void
Molecule::add_right(const Molecule &m)
{
     if (!ats.size()) {
	add(m);
	return;
    }
   Real xof=extent().x.max - m.extent().x.min;
    Molecule toadd(m);
    toadd.translate(Offset(xof, 0.0));
    add(toadd);
}

void
Molecule::add_left(const Molecule &m)
{
    if (!ats.size()) {
	add(m);
	return;
    }
    Real xof=extent().x.min - m.extent().x.max;
    Molecule toadd(m);
    toadd.translate(Offset(xof, 0.0));
    add(toadd);
}


void
Molecule::add_top(const Molecule &m)
{
      if (!ats.size()) {
	add(m);
	return;
    }
  Real yof=extent().y.max - m.extent().y.min;
    Molecule toadd(m);
    toadd.translate(Offset(0,yof));
    add(toadd);
}

void
Molecule::add_bot(const Molecule &m)
{
    if (!ats.size()) {
	add(m);
	return;
    }
    Real yof=extent().y.min- m.extent().y.max;
    Molecule toadd(m);
    toadd.translate(Offset(0,yof));
    add(toadd);
}

void
Molecule::operator = (const Molecule&)
{
    assert(false);
}

Molecule::Molecule(const Molecule&s)
{
    add(s);
}

void
Molecule::print() const
{
    for (PCursor<Atom*> c(ats); c.ok(); c++)
	c->print();
}